全南县中医院创建于1984年12月，是一所集医疗、教学、科研、康复保健、社区卫生服务于一体的综合性“二级甲等”中医医院。医院先后成为赣南医学院第一附属医院协作医院、赣州市中医院协作医院。中医院是全南县中医药文化和技术的传承基地。中医院先后荣获赣州市“文明单位”、赣州市“文明示范窗口单位”、赣州市“群众满意医院”、赣州市“十五中医工作先进单位”等荣誉称号。
全南县中医院是赣州市文明单位，也是赣南医学院第一附属医院的协作医院。属非营利性医院。中医院实行董事会领导下的院长负责制。全南县中医院是全县的城镇职工和城镇居民医疗保险定点医院、新型农村合作医疗定点医院，是各种商业保险定点医院，是全县各企、事业单位干部职工健康体检定点医院，更是全县中医药文化和技术的传承基地。
医院设有内科、外科、妇产科、儿科、急诊科、骨伤科、肝病科、针灸康复科、肛肠科等9个临床科室，其中肛肠科、骨科、针灸科为中医特色专科，设有检验科、核磁共振室、CT室、DR室、彩色B超室、心电图室、胃镜室、经颅多普勒室等8个功能科室，设有办公室、医务科、财务科、总务科、护理部、医保科、院感科、信息科8个行政职能科室。
医院注重自身“硬件”建设，为全南人民提供了优质服务，创造了独特的中医特色，树立了良好的医疗形象，打造了中医品牌。近期引进全县首台核磁共振机，现拥有CT机、DR机、24小时动态心电图机、心电监护仪、全自动生化仪、彩色经颅多普勒仪、日本“富士”电子胃镜、腹腔镜、彩色B超机、万能手术床、肝病治疗仪、全自动煎药机、电动牵引床等一批现代医疗诊治设备。
医院已开展了普外常规手术，如胃大部分切除术、疝补片修补术、甲状腺手术、乳腺手术、胆囊手术、阑尾手术、泌尿系结石取石术、人工股骨头置换术、各型骨折内固定术、关节融合术等普外、骨科、妇产等手术；继承和发展中医针灸、理疗、推拿等传统中医药文化技术。尤其是骨伤科，采用手法整骨、中医中药等综合治疗，取得了良好的临床疗效，获得了社会的高度赞誉。同时医院发挥中医药优势，在专病医疗方面也具有较好的临床疗效，如中西医结合治疗肝病、结石病、脾胃病、腰腿痛等方面。
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