东兰县妇幼保健院工作职能是为妇女儿童身体健康提供保健服务:女子青春保健、女子婚前保健、孕产期保健、妇女更年期保健、妇女心理卫生保健;新生儿疾病筛查、新生儿保健、儿童营养发育与指导、儿童口腔保健、儿童听力保健、儿童眼保健、儿童康复保健、儿童集体保健;遗传病筛查、产前诊断与接生、高危孕产妇筛查监测与监护、高危新生儿筛查、治疗与监护、儿童疾病防治、妇幼卫生监测、信息管理、妇幼卫生保健人员培训。
东兰县妇幼保健院内设机构有办公室、医务科、护理部、财务室、保健科、信息科、药房、消毒供应室;住院科室设有妇产科、综合科;门诊科室设有急诊科、妇产科、儿科、综合科、婚检科、儿保科、妇保科等;医技科室设有放射科、检验科、B超心电图科。