广州医科大学附属第三医院成立于1899年12月12日，原名柔济医院，是国内第一家女子西医学校附属医院，也是最早的西医医院之一，位于广州市繁华的西关地区，毗邻风景秀丽的荔湾湖畔。1953年更名为广州市第二人民医院，2006年转入广州医学院，为广州医学院附属第三医院，2013年随大学更名为广州医科大学附属第三医院，是荔湾区唯一一家集医疗、教学、科研于一体的大型三级甲等综合医院。医院历史悠久，综合实力强大，孕育了享有“南梁北林”美誉的妇产科专家梁毅文博士、外科专家王怀乐博士、广东省首二例试管婴儿之父陈元本教授等一代医学大师。
医院专科特色突出，是广东省产科临床质量控制中心、广东省省级重症孕产妇救治中心、省级产前诊断专项技术指导中心、省级重症新生儿救治中心，是国家药物临床试验机构和广东省法医物证司法鉴定机构，获国家干细胞临床研究备案机构（第二批）。
目前，临床医学、全科医学是广东省重点学科；新生儿科是广东省临床重点专科、广东省新生儿保健特色专科，曾成功抢救广州市最低体重仅465克的超早产儿；临床护理是广东省临床重点专科；生殖医学科、妇科为广州市重点学科；妇科、生殖健康与不孕症专科为广州市高水平临床重点专科；老年病科为市级中医特色专科培育项目；脊柱外科开展微创领域的新方法——极外侧入路腰椎融合手术（XLIF）、关节外科成功开展国内首例脚踝3D打印植入术、广东首例AI术前规划系统辅助全膝关节置换手术；器官移植科、心血管内科、神经内科、呼吸内科、重症医学、肝胆外科、胃肠外科、乳腺外科、血管外科、神经外科、泌尿外科、中医科等学科在广东省、广州市内均有美誉，内镜、腹腔镜、微创、影像学介入等诊疗技术是医院特色。
医院的“国家级胸痛中心”“国家高级卒中中心”等承担了区域内急危重患者快速救治工作，并成为全国首批授牌的卒中中心联盟医院和广州市首批卒中急救地图医院，同时获得广东省胸痛中心示范基地、国家房颤中心建设单位、广东省首批心血管疾病介入诊疗技术培训基地、国家心脏康复中心示范单位、国家高血压达标中心示范单位。
医院拥有高水平的医学科学研究平台，1989年建立广州妇产科研究所，形成重症孕产妇临床救治与围产医学、生殖与遗传、妇科肿瘤为三大研究方向。现拥有广东省产科重大疾病重点实验室、广东省生殖医学重点实验室（与中山大学附属第一医院共建）、广东省高校生殖与遗传重点实验室、广东省母胎医学工程技术研究中心、广东省“2011”协同创新中心、广州市生殖与遗传重点实验室、广州医科大学DAMP研究中心、3个高水平联合创新实验室、1个院士工作站、妇科肿瘤实验室、生物样本库等。2017年，成立广州医科大学再生医学与3D打印转化研究中心，现为广东省普通高校生物医学工程技术研究中心、呼吸疾病国家重点实验室-组织工程与再生医学平台、组织工程国家工程研究中心华南分中心。近五年，获得国家自然科学基金、省科技厅重大攻关项目等资助项目500多项。创办了《中华产科急救电子杂志》，发表科技论文1400多篇，SCI收录论文500多篇，在《The Lancet》、《Cell》、《Cell Stem Cell》等国际顶级医学刊物发表研究成果，医院2017、2018年均上榜自然指数（Nature Index）top100。
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