巢湖市第二人民医院始建于1952年,前身为安徽省第六康复医院(俗称三康医院),1984年更名为“巢湖市人民医院”,1999年更名为“巢湖市第二人民医院”。2011年,随着行政区划调整,医院为合肥市卫生局所属巢湖第二人民医院。
医院位于巢湖市中心区,全院占地面积5万平方米,建筑面积4万平方米,现有床位编制786张,设有门诊部和住院部两大区域。设有15个病区,32个临床一、二级学科,10个医技科室,拥有德国西门子1.5T磁共振(含类PET功能)、64层螺旋CT机、DR、DSA、数字平板胃肠机、美国GE全身彩超(含心脏专用彩超)、数字乳腺钼靶、肺功能、脑电、肌电、动态心电、血压,血透机(含CRRT),快速冰冻切片机,腹腔镜、胆道镜、前列腺汽化电切镜等系列腔镜,罗氏化学发光仪、全自动酶免分析系统、全自动微生物培养鉴定系统等高新进口医疗设备。4870平方米门诊楼和16500平方米的现代化住院大楼,耸立在城中央并成为标志建筑。正在装潢的总建筑面积16406㎡的医技楼计划年内投入使用。
巢湖市第二人民医院现为安徽医科大学、皖南医学院、安徽中医药大学、合肥职业技术学院教学医院,巢湖市医疗保险定点单位,设有120急救分中心、中国初级卫生保健基金会健康扶贫工程“宫颈癌筛查基地”。与南京鼓楼医院建立了医疗技术协作体和技术管理培训基地,并加入安徽省立医院网络医院。
医院长期坚持科教兴院、人才强院的发展战略,经过不断发展,医院在儿科、神经内科等一批重点学科的基础上,心内科、普外腔镜手术、泌尿外科、新生儿科、ICU、麻醉科、妇产科等发展迅速,成为本院特色及当地有影响力的学科,2013年9月该院心血管内科被评为合肥市重点特色专科。 曾先后获得安徽省文明医院、安徽省防治“非典”工作先进集体、安徽省卫生先进单位、合肥市文明单位。