马尔康市人民医院前身为私人诊所，1958年完成公私合营的社会主义改造，更名为马尔康城关卫生所，1978年更名为马尔康县中医门诊部，2004年升格为马尔康县中藏医院，2013年曾挂县人民医院牌子，实行两块牌子一套人马，合署办公。原址在马尔康镇崇列街58号，2013年10月27日迁入现址。2015年马尔康撤县设市，县人民医院更名为市人民医院，现址位于马尔康市俄尔雅新区。
医院占地面积6667平方米，建筑面积10720平方米，有在职职工158人，其中本院在职在编职工108名，援藏干部25名，临聘专业技术人员14人，非专业工作人员11名。全院共有卫生专业技术人员137名，占比86.7 %。卫生技术人员中：高级12人、中级34人，占比33.6%。设内科、外科等临床一级科室12个，医技科室4个；职能科室7个。编制床位120张，开放床位100张，有DR、彩超、电子胃镜、全自动生化仪、腹腔镜、三分类五分类血球计数仪、肺功能监测仪、多功能及心电监护仪、除颤仪、动态心电、血压监测系统、脑电图、电脑控制三维牵引床、蜡疗机、中频治疗仪、阿是穴治疗仪等大、中型设备50余台（件），为医院发展奠定了坚实基础。手术室为万级层流手术室，实现了HIS、类电子病历、合理用药、处方点评系统全面建成。
马尔康市人民医院主要承担辖区内临床医疗、急诊急救、预防保健、各类体检、突发公共卫生事件、各种医疗保障、乡村医师培训等任务。
自2010年四川省启动援藏十年行动计划以来，该院迎来了成都医学院附属医院、四川省骨科医院、广安市各级医院、崇州市各级各类医疗机构的大力支援，先后选派不同专业的援藏干部78名到该院支援，目前该院有援藏干部25名，其中博士2名，硕士5名，对提升医院服务能力起到了重要作用。
在全院职工共同努力下，2014年成功创建国家二级乙等民族医医院，2017年成功创建“二级甲等综合医院”。先后获得四川省抗震救灾工人先锋队、阿坝州巾帼文明岗、马尔康市优秀基层党支部等集体荣誉，多名职工获得国家、省、州先进个人称号。
2018年马尔康市人民医院按照州委州政府安排部署，开始筹建设阿坝州马尔康精神卫生康复中心，经过不断努力，精神卫生康复中心于2018年8月改造完毕，并开始收治病人。随着精神卫生康复中心的投入使用，全院职工以更加饱满的热情投身到医院发展建设中去，优化医疗服务流程，改善患者就医体验，倡导精细化管理，发挥质控体系功能，持续改进医疗质量，完善制度建设，强化行风，厉行节俭，构建和谐医患关系，增强医院可持续发展能力，为人民群众提供安全、有效、方便、廉价的基本医疗服务，努力开创各项工作新局面。
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