且末县维吾尔医院成立于1980年，是一所集医疗、保健、预防、康复为一体的综合性二级乙等医院。执业许可范围包括临床科室9个（内科、儿科、妇科专业、外科、皮肤科专业、肛肠科，推拿科、康复医学专业、维吾尔医学），医技医技科室3个（医学影像科、医学检验科、药械科），行政职能辅助科室6个（门诊、医务科、护理部、院办、财务科、后勤）。医院目前现设有科室6个，即门诊部、住院部、康复理疗科、药械科、综合办公室、财务科。该院在心血管病、皮肤病、妇科疾病等方面，诊疗效果显著。
医院医疗技术不断提高，医院就诊环境明显改善，且末县维吾尔医外科能够开展常见普外科及骨科常见疾病的维吾尔医疗法的特色治疗，维吾尔医内科对内科常见病多发病、高血压病、糖尿病、风湿病、气管炎、哮喘、胃肠病、肾病、肝胆疾病疗效明显，尤其擅长治疗高血压、肺源性心脏病，风湿病、慢性支气管炎等疾病。维吾尔医皮肤科对各种常见皮肤病的维吾尔医疗法效果良好，尤其治疗带状疱疹、湿疹、银屑病效果显著。结合科室实际情况，分类确定辩证施护病种，实施中医特色护理服务，有效开展中药贴敷、拔罐、中药熏洗等中医护理服务，成为“优质护理示范病房”的特色服务项目和亮点，深受患者好评。选派专业技术人员下乡业务指导及开展培训，义诊等，大力宣传国家有关中医药的方针政策，普及中医药知识，健康与疾病等方面的基本理念和保健知识，掌握常见的中医药养生保健方法。医院从2019年10月份开始整体搬迁到县人民医院门诊三楼联合办公。
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