2004年苏州市政府为优化市属医疗资源，实施了苏州卫生史上规模最大的调整，原苏州市第二人民医院、市第三人民医院、市第四人民医院，三所有着50多年历史的市级综合医院，于2005年1月1日，合并建立苏州市立医院。
医院谨记为人民群众健康服务的医疗卫生事业宗旨，以“博爱、诚信、敬业、创新”为导向，整合资源、创新管理、提升内涵，努力提供高品质的医疗服务，在赢得患者的同时，实现了自身的快速发展。现已成为拥有3个综合性院区、3个市级诊疗中心、1个教学基地、1个司法鉴定所和4个社区卫生服务中心，2200余张床位的大型综合性医院。同时是南京医科大学附属医院和南医大研究生培养基地，卫生部全科医师规范化培训基地，江苏省母婴护理专科培训基地，年门急诊总量340万人次，出院病人10万人次，医疗服务总量省内领先。
医院积极追踪学科融合、交叉发展的新趋势，借助医学技术进步，积极建设学科群组和新兴专业，形成了“以诊疗中心为主体、重点专科为骨架、特色专科为支撑”的专科体系。现有苏州市母子医疗保健中心、市肿瘤诊疗中心和市卒中中心3个市级医疗中心，苏州市体检中心也设在该院。有超声科、消化科、产科3个省级重点专科，辅助生殖、新生儿疾病筛查、儿童保健科3个省妇幼重点学科，生殖遗传中心、骨科、妇产科、肿瘤科、心血管内科、新生儿科、影像科、重症医学科、检验科、烧伤整形科、血管外科等11个市级重点学、专科，以及超声、消化、临床检验3个市级质量控制中心。老年病科、肾内科、麻醉科、微创外科等也形成了专业特色。
医院拥有双光子高能直线加速器、PET-CT、64排128层螺旋CT、ECT、1.5T核磁共振、大型平板DSA、DR等大批先进医疗设备，以及胶囊内镜、小肠镜、血管镜、TPS精确放疗系统、悬浮床、新生儿监护系统、遗传分析仪、胎儿多普勒等先进专科设备。围绕“以病人为中心”的理念，医院不断完善人性化服务。开通集电话预约、出院回访、满意度测评、健康指导为一体的“健康快线”客服中心和“母婴宝”短信平台，建立产检绿色通道和馨怡肿瘤患者健康俱乐部。创新门诊“一卡通”，医技检查集中预约、医疗项目集中审批、转运护送等服务，高素质的导医队伍，夜门诊和专家垂直门诊，网络和诊间预约，为患者提供了便捷、温馨的服务。一支以党员、青年团员、社区居民为主的志愿者队伍，走进社区、奉献社会，创立了健康顾问志愿品牌。认真履行公立医院社会职责，开展公惠医疗、“六位一体”社会卫生服务、特困人群医疗救助、出生人口缺陷筛查、高龄老人免费体检、社区科普、妇幼保健等公益性卫生服务，每年受益人群近25万人次。
医院始终以人才带科研，以科研促临床。由省医学重点人才、省“333”工程培养对象、姑苏卫生人才组成的高层次人才队伍，40名全国专业委员会委员和省、市各专业委员会主委、副主委组成的学科带头人队伍，30多博导、硕导组成的教学师资队伍，引领了医院医教研的全面发展。建筑面积8000平方米、功能齐全的综合教学基地，承担了江苏省和苏州市的部分医师考核任务，建立了苏州市肿瘤诊断与治疗重点实验室，与复旦大学合作创办了苏州（复旦）生命科学联合实验室，连续获得国家、省自然基金课题和省新技术引进奖。
近年来，医院先后获得全国三八红旗集体、省卫生系统医疗服务先进单位、省群众满意的医疗机构、省卫生系统先进基层党组织、江苏省患者安全目标管理合格医院、江苏省平安医院、省卫生系统城乡对口支援工作先进集体、苏州市文明单位、省青年文明号、卫生部、省卫生厅优质护理示范工程优秀病区、苏州市平安医院创建示范单位等荣誉和表彰。
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