臺北市立萬芳醫院－委託財團法人臺北醫學大學辦理地處昔日「萬隆」與「芳川」兩礦場，「萬芳」之名由此而來。自1989年動工興建，臺北市政府為減少每年新台幣五億元的公務預算支出，及藉助民間機構經營效率，決定將臺北市立萬芳醫院委託民間經營。歷經多次審慎的公告招標，1996年7月委託給臺北醫學大學經營，於1997年2月15日正式開幕服務市民，成為台北市第一家公辦民營的市立醫院。
本院與捷運文湖線共構「萬芳醫院站」，距離北二高萬芳交流道五分鐘，對外交通便利。市立萬芳醫院為726床的醫學中心，建築物分為第一大樓與第二大樓兩棟建築物，第一大樓地上 13 層地下3層，地下二、三樓有二百餘個停車位，來院停車方便；第二大樓共七層，可提供單身醫護行政同仁住宿。文山區為一典型的住宅文教區，且因應人口老化之趨勢發展，特將社區醫療設定為發展重點之一，並堅守對社區的承諾，期待成為一所服務、品質、效率俱優的公辦民營醫學中心，擔負公衛責任，服務範圍由台北市南區、新北市周邊、醫療偏遠地區、更擴及服務至國際醫療。
臺北市立萬芳醫院具有急重症病患醫療能力與品質，2010、2014年通過癌症診療品質認證；2011、2013年通過國家級重度急救責任醫院，本院外傷醫療已達美國一級外傷中心的規格。除此之外，更積極豐富多項緊急救治醫療資源：針對急性腦中風的患者，提供黃金三小時內完成血栓溶解劑治療，有助搶救急性中風患者；以及90分鐘內緊急執行急性心肌梗塞患者之心導管手術。此外，本院不斷積極延攬醫療精英，強化醫療陣容，設立結核病中心、癌症中心、中風中心、電腦刀中心、高壓氧中心、中西醫整合疼痛治療中心、燒傷及困難傷口全人照護中心、生殖醫學中心、雷射美容中心、用藥諮詢中心、幹細胞研究中心…等發展多元具有特色的醫療發展中心。
接辦台北市第一所公辦民營的醫院是件意義深遠的任務，臺北醫學大學將持續以優良的傳統與團隊資源，並本著戒慎戒懼的心情，共負市醫責任，服務市民以病人為尊，並致力於教學、研究、服務與社區醫療的提升，堅持不斷成長「以北醫，萬芳為榮」建立服務品質、經營績效俱優的公辦民營的醫學中心。
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